Libération de trf

Seul, on va plus vite.
Ensemble, on va plus loin.
-- proverbe vraisemblablement Africain

Palaiseau, le lundi 29 juin 2020

Cher Journal,

L'empaquetage de la suite VirusSeeker nécessite un certain nombre, et je dirais même plus un nombre certain, de dépendances. Dans le lot, l'une des dépendances, nommée TRF et développée à l'université de Boston, était un logiciel non libre dont le code source n'était pas publié. Mais tout ceci est du passé, désormais ce programme est disponible sous licence AGPL-3, et le code source de trf est disponible en ligne.

Voici en quelque liens, l'historique de la libération du programme. Il faut noter que les développeurs en amont avaient déjà la volonté, mais pas forcément les ressources, de libérer leur logiciel :

• Juin 2016 : Andreas Tille et Michael R. Crusoe contactent le mainteneur de trf afin de libérer le code source, mais l'auteur original, manquant à l'appel, est nécessaire pour influer sur la licence.
• Mai 2020 : après diverses incitations à contacter les développeurs en amont pour la libération de divers logiciels, je me permet d'envoyer un courriel aux contacts en charge de trf. L'auteur répond en indiquant son choix de licence libre pour son logiciel, ce qui est extrêmement prometteur.
• Juin 2020 : les développeurs de trf contactent Andreas Tille avec l'adresse du dépôt de code source ; Tandem Repeats Finder est libéré !

Andreas a commencé à travailler sur le paquet trf aujourd'hui. L'empaquetage de trf pour Debian a lieu dans Salsa, et le programme est déjà dans la file d'attente des nouveaux paquets. Il devrait être disponible dans Sid incessamment sous peu.

C'est vraiment une bonne nouvelle. Et du coup, j'ai de nouveau pas mal de travail en perspective, puisqu'il est possible d'avancer sur le sujet.  :)

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