Rosetta@home

Palaiseau, le vendredi 27 mars 2020

Cher Journal,

Pendant que la situation semble se tasser ici, ailleurs mes homologues commencent à être dans une situation un peu compliquée. Là où en France, il y a la queue pour se rendre à un magasin quasiment vide de gens, mais relativement correctement achalandé ; outre Manche, non seulement la queue en question va faire dans les cinq cent mètres, mais en plus le magasin va être rapidement vide de denrées, en plus de personnes.

Maintenant passons à la partie utile de l'entrée de journal. Apparemment, après rapide renseignement, il y a un projet Boinc dont les travaux sont actuellement orientés vers la recherche de soins contre les agents pathogène. Il s'agit du projet Rosetta@home. Historiquement, ce projet s'est concentré à trouver des soins contre la malaria, l'anthrax et le VIH. À la vue du nom du tout premier job que j'ai pu voir passer, une autre protéine est manifestement dans leur viseur en ce moment :

J'essaie de garder un œil sur l'état des jobs. Les trois premiers sont partis en erreur de segmentation (signal 11), mais je ne sais pas pour le moment si ça vient de ma configuration, ou bien d'une erreur de programmation du côté du laboratoire. Les autre projets sur lesquels je dédie également de la puissance de calcul vont être mis en pause une fois que les jobs en cours seront terminés. Au passage, la page de monitoring a nécessité une petite mise à jour, les jobs Rosetta étaient reconnus en tant que projets boinc à l'instant t-1, ça faisait désordre. Le script de monitoring modifié est joint à cet article, mais la modification fait un peu tâche ; la modification est facile à repérer, il y a un commentaire qui commence par Ugly hack dans une fonction laide.

Peut-être que c'est l'occasion de faire une belle correspondance bien propre entre le nom du projet et l'URL, mais ce sera pour un autre jour.

Toujours dans la même veine, Andreas Tille, du projet Debian, vient à l'instant d'annoncer la tenue d'un Biohackathon, du 5 au 11 avril 2020.

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[   ]html-machine-status2020-03-27 21:06 3.7K

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